Règne (biologie)

Le règne (du latin « regnum ») est, dans la taxonomie linnéenne (qui organise la biodiversité en fonction des caractères communs partagés), le plus haut niveau de classification des êtres vivants. Dans les classifications les plus récentes, le règne n'est plus que le deuxième niveau de classification après le domaine [1], [2] ou bien l' empire [3].

Chaque règne est divisé en embranchements (ou parfois divisions en botanique) que l'on nomme également phylum en latin comme en anglais. Les principaux niveaux de la classification taxonomique sont le monde vivant, l' empire ou le domaine, le règne, l' embranchement ou la division, la classe, l' ordre, la famille, le genre et l' espèce.

Une révision controversée de la classification a été proposée par Carl Woese en 1990 après avoir observé ce qui semblaient être de grandes différences au niveau moléculaire chez les bactéries et les archées en dépit du fait que les deux groupes sont composés d'organismes procaryotes. Woese a alors entrepris d'établir un système de classification à trois domaines : les bactéries, les archées et les eucaryotes (ce troisième domaine regroupant les plantes, les animaux, les protistes et les champignons). L'utilisation actuelle du système à sept règnes constitue un compromis entre le système classique à cinq règnes de Whittaker et du système à trois domaines de Woese. Ce système à sept règnes où les procaryotes sont scindés en bactéries et archées est devenu le standard dans de nombreux travaux.

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Classification scientifique traditionnelle

La classification traditionnelle de Linné (1735) en deux groupes (végétal / animal) a évolué pour aboutir à la constitution des six règnes du vivant selon la biologie [4], [5], [6] :

  • les archées ou formellement Archea (procaryotes unicellulaires à histones) ;
  • les bactéries ou formellement Bacteria (procaryotes unicellulaires sans histone) ;
  • les protistes ou formellement Protista (eucaryotes unicellulaires), ancien règne classique dont avaient ensuite été retirés les procaryotes (archées et bactéries format leur propre règne), et aujourd'hui divisé entre protozoaires (ou formellement Protozoa) et chromistes (ou formellement Chromista, incluant les algues brunes)
  • les végétaux ou formellement Plantae (eucaryotes multicellulaires avec une vacuole, incluant également les algues vertes) ;
  • les mycètes ou formellement Fungi, communément les champignons (eucaryotes multicellulaires pour la plupart mais unicellulaires pour certains [7], hétérotrophes et osmotrophes), qui ont été retirés de l'ancien règne végétal ;
  • les animaux ou formellement Animalia (eucaryotes multicellulaires).

D'après la classification en 6 règnes ( Carl Woese, 1977), est prise en considération, sur la base de l'analyse des séquences d' ARN ribosomique (16S ou 18 S), la proposition de diviser le monde vivant en trois « règnes primaires », ceux des archéobactéries, des eubactéries et des eucaryotes [8].

Il s'est produit, au cours de l'évolution cellulaire des organismes, une coupure fondamentale qui distingue le groupe des eucaryotes et celui des procaryotes

Les « procaryotes » (Procaryota) sont unicellulaires mais peuvent être multicellulaires [9] (exemple : Trichodesmium, un genre de cyanobactéries filamenteuses), et leur matériel génétique n'est pas enfermé dans un noyau. Ils possèdent des enzymes localisés dans la paroi cellulaire et se multiplient par scissiparité. Ils constituent les deux premiers règnes.

Tous les autres organismes sont appelés des « eucaryotes » (Eukaryota). Leur matériel génétique est enfermé dans un noyau ; ils possèdent des organites cellulaires, la multiplication cellulaire a lieu par mitose et ils présentent souvent une reproduction de type sexuée.

Les eucaryotes peuvent être unicellulaires ou pluricellulaires. Les eucaryotes unicellulaires sont appelés des protistes et constituent le troisième règne.

Enfin, les eucaryotes pluricellulaires sont divisés en 3 règnes, le règne fongique (champignons), les métaphytes (végétaux chlorophylliens) et les métazoaires (animaux pluricellulaires).

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