Cette espèce fut décrite par E. Sivertsen en 1953. Elle a d’abord été considérée comme une sous-espèce de Zalophus californianus mais en 2007 des données génétiques ont apporté la preuve que Zalophus wollebaeki est bien une espèce distincte qui se serait séparée de l’ancêtre commun il y a environ 2,3 millions d’années (à 0,5 millions d’années près)[1].
